Lo svantaggio è che il congelamento rapido ha grossi limiti:

① Non tutti i materiali per biopsia sono adatti per l'esame con congelamento rapido. È adatto solo per l'esplorazione chirurgica degli organi di superficie (come la mammella e la tiroide) o degli organi interni e dovrebbe essere usato quando benigno e maligno. Tuttavia, non è applicabile ad alcune malattie e tumori complicati (come il linfoma) che richiedono l'identificazione di microstrutture cellulari. ② Limitato dal campionamento, spesso falso negativo (diagnosi mancata).

(3) A causa del breve tempo di preparazione e colorazione, della sezione spessa, del tessuto e della struttura cellulare più chiari rispetto alla normale sezione di paraffina e della necessità di completare l'osservazione, l'analisi e la diagnosi in pochi minuti, non c'è più tempo per pensare, non per non parlare del tempo per trovare letteratura, quindi la diagnosi è difficile, spesso hanno bisogno di patologi esperti.

④ A causa dei motivi di cui sopra, e il suo tasso di accuratezza è solo del 90 percento circa, il tasso di errore e il tasso di falsi negativi sono alti e può verificarsi anche il tasso di falsi positivi. Pertanto, la biopsia rapida congelata è solo una diagnosi qualitativa preliminare di emergenza. Successivamente, i materiali bioptici congelati devono essere trasformati in normali sezioni di paraffina per l'esame patologico prima che venga effettuata la diagnosi finale. In caso di mancata diagnosi o diagnosi errata di crioconservazione intraoperatoria, deve essere eseguita una seconda operazione o altre misure correttive.

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